Městečko Mali Lošinj leží na jihovýchodním konci dlouhého úzkého zálivu na jižní straně ostrova Lošinj, který je jedním z největších ostrovů v Jaderském moři. Je zajímavostí, že je to nejvíce obydlené místo na ostrově, byť je tu i Velki Lošinj, hlavním městem ostrova Lošinj je od roku 1806.